Fiasco-STR引物开发技术服务(Fiasco)
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0 楼 发表于  2016/8/15 9:50:42    编 辑   

                    Fiasco-STR引物开发技术服务(Fiasco)
   SSR标记是一种基于DNA长度多态性的分子标记技术。它具有共显性、高度可重复性、是研究群体遗传学、进行分子标记辅助育种、系谱分析和法医鉴定的理想工具。只因为SSR标记具有种族特异性,必须采用特异引物进行PCR检测,故而存在一个引物开发的问题。磁珠富集法开发未知基因组序列物种的引物,通过PAGE验证,可以清晰的分析出多态引物,用于后边的批量试验。
1)SSR-开发技术路线
前期确认阶段:试验样本类型,数量,签订试验合作合同;
试验阶段:(30个工作日)包括选取4-6个样本进行多态性验证;
试验结果:通过磁珠富集微卫星序列, 
2) 试验案例:我们已经开发过多个树种,昆虫,花卉,藻类植物,大型真菌等。例如松树、槭树、桑树、毛竹、兰花、萤火虫、月季、食用真菌、鱼,虾等。
3)SSR开发服务内容
1 样本基因组DNA的提取;
2 构建文库并对特异性序列进行测序;
3 4-10个样本的PAGE(JY-CX2B型 测序电泳槽)验证图;
4开发出30—40对具有一定重复特征的微卫星引物,并且对引物进行多态性和特异性验证;
5提供保证8条以上多态性引物; 
4)客户提供:
A. 基因组DNA:至少50μL样品,浓度为50-100ng/μL;
B.2%琼脂糖电泳检测有DNA主带,没有降解;
C.DNA经过DNA纯化试剂盒或磁珠纯化;
D. DNA需溶解在TE里;
E. DNA溶解后,肉眼看不到杂色;

 
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